More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4355 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  81.89 
 
 
278 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  82.35 
 
 
262 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  78.63 
 
 
284 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  77.46 
 
 
262 aa  397  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  73.06 
 
 
270 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  71.88 
 
 
256 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  72.92 
 
 
264 aa  359  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  71.37 
 
 
286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  62.79 
 
 
259 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  62.96 
 
 
269 aa  322  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  62.96 
 
 
258 aa  322  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  60.38 
 
 
274 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  65.42 
 
 
258 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  59.44 
 
 
266 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  60.58 
 
 
267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  60.5 
 
 
284 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  61.25 
 
 
274 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  57.25 
 
 
376 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  56.87 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  61.34 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  61.34 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  61.34 
 
 
271 aa  301  9e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  59.75 
 
 
287 aa  298  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  61.51 
 
 
274 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  61.51 
 
 
274 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  61.51 
 
 
274 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  60.25 
 
 
266 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  54.36 
 
 
242 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  53.72 
 
 
251 aa  258  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
245 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  53.14 
 
 
245 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  46.53 
 
 
248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  42.29 
 
 
249 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 
251 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
274 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
265 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
249 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
280 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 
246 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  33.46 
 
 
256 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
246 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
308 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  31.91 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  33.05 
 
 
240 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
243 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
277 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
240 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
243 aa  122  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
246 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
241 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  32.76 
 
 
277 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
245 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
245 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 
261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 
261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
278 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
247 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 
278 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 
247 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
240 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
243 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  33.47 
 
 
273 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
248 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 
243 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
255 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 
288 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
239 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
249 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
240 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 
244 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 
247 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
247 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.35 
 
 
243 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
249 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  29.33 
 
 
243 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  29.33 
 
 
243 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>