More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0756 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  100 
 
 
240 aa  494  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  99.17 
 
 
240 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  99.17 
 
 
240 aa  487  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  99.17 
 
 
240 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  99.17 
 
 
240 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  99.17 
 
 
240 aa  488  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  98.75 
 
 
240 aa  486  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  39.48 
 
 
235 aa  175  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
248 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 
247 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 
252 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
248 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
243 aa  122  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 
242 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
232 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
238 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 
244 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 
241 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
236 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.02 
 
 
243 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 
237 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
245 aa  111  9e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
246 aa  111  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 
256 aa  111  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
240 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
245 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
241 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
232 aa  108  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 
241 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
242 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 
246 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  31.16 
 
 
231 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
255 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 
245 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 
242 aa  105  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
245 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 
245 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 
239 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 
238 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
235 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 
239 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
248 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  30.3 
 
 
231 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
248 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  32.3 
 
 
252 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
235 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 
246 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
251 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  32.47 
 
 
250 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 
242 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
249 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 
245 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 
244 aa  102  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
232 aa  101  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
245 aa  102  8e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
248 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
248 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 
249 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  27 
 
 
245 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
270 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
242 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 
245 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 
245 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
243 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
241 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 
244 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
238 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
241 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.68 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.17 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
308 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 
234 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
258 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>