More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3697 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  86.99 
 
 		 248 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  71.91 
 
 		 268 aa  337  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  68.78 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  67.93 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  66.95 
 
 		 269 aa  322  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  69.23 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  59.23 
 
 		 249 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  57.26 
 
 		 244 aa  274  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  50.65 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  47.19 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  45.89 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.65 
 
 		 246 aa  191  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 245 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  46.09 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  43.48 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.13 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1316  GntR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 237 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.87625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  43.33 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  40.5 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  41.87 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.49 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.33 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  39.83 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  40.52 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 240 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  41 
 
 		 241 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 278 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.41 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 239 aa  125  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  37.7 
 
 		 185 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.62 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.11 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.19 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.78 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  32.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.28 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>