More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1424 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  72.08 
 
 		 266 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  67.36 
 
 		 246 aa  313  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  59.66 
 
 		 245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  45.73 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  44.44 
 
 		 243 aa  181  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  46.09 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  46.35 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  45.31 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  44.92 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  44.05 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  43.33 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  43.28 
 
 		 239 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  42.74 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  43.72 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  42.49 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 240 aa  155  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  44.02 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  40.68 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  40.59 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  40.09 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  38.89 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.22 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 242 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.87 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.91 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  124  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  40.27 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 257 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 278 aa  121  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  37.23 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.48 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  30.86 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.33 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.46 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 259 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>