More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4030 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  81.82 
 
 		 245 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  80.25 
 
 		 247 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 246 aa  322  5e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  67.21 
 
 		 245 aa  318  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  62.14 
 
 		 245 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  58.78 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  59.92 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  60.33 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  61.57 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  55.51 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  51.22 
 
 		 246 aa  245  6e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  53.69 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  52.7 
 
 		 255 aa  228  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 252 aa  228  8e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  52.92 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  47.76 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.48 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  39.83 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.47 
 
 		 240 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 288 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.19 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  31.03 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.03 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.03 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  31.03 
 
 		 240 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.03 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0903  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.634151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.07 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.45 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.91 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  33.91 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 278 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.48 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  34.08 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  99  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  29.71 
 
 		 243 aa  99  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.63 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 238 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.77 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>