More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2963 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 		 241 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 239 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 239 aa  244  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  47.44 
 
 		 245 aa  228  9e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  41.3 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  40.35 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.31 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 225 aa  138  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  31.74 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  32.48 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.91 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.06 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 261 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 257 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  29.79 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.43 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30 
 
 		 255 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.63 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  27.19 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>