More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9090 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 240 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  51.07 
 
 		 278 aa  237  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  53.11 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 244 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.13 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  38.99 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  39.27 
 
 		 243 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 255 aa  141  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 249 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 243 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  40.44 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  38.7 
 
 		 269 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  38.79 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 241 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 195 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  40.72 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.84 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  39.09 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.89 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  38.91 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.74 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  32.07 
 
 		 233 aa  105  5e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 286 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4184  transcriptional regulator, GntR family  31.89 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000338347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 251 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.78 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>