More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2648 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 254 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  97.64 
 
 		 254 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  72.11 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 257 aa  335  5e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 257 aa  335  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  69.4 
 
 		 256 aa  331  6e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  59.59 
 
 		 250 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  58.7 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  52.17 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  49.37 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  52.61 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  52.32 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  51.28 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 255 aa  204  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  48.93 
 
 		 241 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 286 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 251 aa  195  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  43.8 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 264 aa  175  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  42.36 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  169  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  41.88 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 244 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  41.48 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  37.71 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.64 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.98 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  38.1 
 
 		 232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  39.04 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 252 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  39.48 
 
 		 269 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  38.37 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>