More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2355 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  97.07 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  54.47 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  46.36 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  45.91 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 242 aa  168  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  39.11 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  38.22 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  37.78 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  40.17 
 
 		 253 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 237 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  40.87 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  40.87 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  40.87 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  40.87 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  40.87 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  35.53 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  39.74 
 
 		 239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  37.88 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.88 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.75 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.64 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  31.11 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.12 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 264 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 260 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.11 
 
 		 272 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.96 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 235 aa  95.1  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.86 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 253 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.57 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 254 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  26.57 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  26.57 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>