More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  99.58 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  83.19 
 
 		 238 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  74.58 
 
 		 237 aa  362  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  74.37 
 
 		 238 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  74.37 
 
 		 238 aa  361  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  73.31 
 
 		 253 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  71.61 
 
 		 239 aa  327  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 237 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 237 aa  321  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  70.04 
 
 		 237 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 236 aa  298  5e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  62.56 
 
 		 235 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  60 
 
 		 235 aa  277  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  49.77 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  46.61 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  46.61 
 
 		 263 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  46.61 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  46.61 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  44.59 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  45.91 
 
 		 239 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  45.91 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 238 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  29.74 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  34.98 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.26 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 244 aa  86.7  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.49 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 242 aa  85.1  9e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  28 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  32.23 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  25.45 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.93 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.86 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.45 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.62 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.1 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.86 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.79 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  24.9 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>