More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1876 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  99.58 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  82.77 
 
 		 238 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  74.58 
 
 		 237 aa  360  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  73.95 
 
 		 238 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  73.95 
 
 		 238 aa  358  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  72.88 
 
 		 253 aa  350  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  71.19 
 
 		 239 aa  325  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 237 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  69.6 
 
 		 237 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 237 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  70.04 
 
 		 237 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  62.11 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  59.57 
 
 		 235 aa  274  7e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  49.32 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  46.61 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  46.61 
 
 		 263 aa  215  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  46.61 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  46.61 
 
 		 234 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  44.59 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  44.59 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  46.36 
 
 		 239 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  46.36 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  29.74 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  34.98 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.94 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  32.7 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.26 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 261 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.36 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  22.55 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  21.46 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.58 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.86 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3696  transcriptional regulator, GntR family protein  25.45 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  25.45 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.62 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4185  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.188072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0886  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  27.96 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>