More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0471 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  99.58 
 
 
239 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  100 
 
 
239 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  99.58 
 
 
239 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  99.58 
 
 
239 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  99.16 
 
 
239 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  49.31 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  45.13 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  43.36 
 
 
234 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  43.36 
 
 
233 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  42.92 
 
 
238 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  42.92 
 
 
238 aa  207  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 
237 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 
237 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  42.92 
 
 
234 aa  207  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  44.59 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  43.89 
 
 
237 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  44.59 
 
 
238 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  41.33 
 
 
242 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  47.47 
 
 
237 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  43.3 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  41.03 
 
 
253 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  40.09 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  42.36 
 
 
239 aa  174  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
238 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  38.77 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  40.17 
 
 
239 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  40.87 
 
 
239 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
237 aa  145  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
235 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.243305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.04 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  33.04 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
236 aa  135  8e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 
236 aa  135  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
236 aa  135  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  32.61 
 
 
228 aa  122  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
238 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  31 
 
 
239 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  31 
 
 
239 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.36 
 
 
243 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  30.57 
 
 
239 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.13 
 
 
239 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  29.26 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
239 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
246 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
255 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
232 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
241 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
244 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 
247 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  32.02 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.18 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
266 aa  89.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.06 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
248 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
243 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
243 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
243 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
243 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.06 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
244 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 
254 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  26.6 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 
238 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
244 aa  85.9  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 
252 aa  85.5  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
244 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>