More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03757 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  487  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  98.73 
 
 		 236 aa  484  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  98.73 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  98.73 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  98.73 
 
 		 236 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  60.52 
 
 		 235 aa  302  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  33.04 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  33.04 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  33.04 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  33.04 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  32.14 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  28.96 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  28.32 
 
 		 253 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  29.41 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  29.41 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  31.67 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 238 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  27.68 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  30.88 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 239 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  24.78 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 252 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.88 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  26.37 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  28.1 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  28.1 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.18 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.11 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  28.1 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  28.1 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.35 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  28.1 
 
 		 239 aa  62  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.45 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  25.11 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.89 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  27.75 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  24.04 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  24.23 
 
 		 246 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>