More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3508 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.3 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.33 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  32.78 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.48 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  32.78 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  32.78 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 248 aa  121  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 269 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 258 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  31.91 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  31.91 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 233 aa  118  9e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  31.91 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  31.91 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 251 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  31.91 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.7 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 242 aa  112  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0740  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.55 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.03 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0056  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.49 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210738 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 238 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.08 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  30.47 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>