More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1710 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  483  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  81.82 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  78.51 
 
 		 247 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  65.31 
 
 		 246 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  65.71 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  62.76 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  59.43 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  60.74 
 
 		 243 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  61.16 
 
 		 243 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  61.98 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  57.61 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 246 aa  245  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  54.96 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  53.53 
 
 		 255 aa  234  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  54.17 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  48.96 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  53.56 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.24 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.58 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  38.08 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  39.41 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 242 aa  112  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.39 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  38.7 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.95 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  33.33 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  32.33 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  37 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.27 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.3 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.52 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.3 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.3 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.3 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.3 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.3 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.34 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.34 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  37.67 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 244 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>