More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1730 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  55.65 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  56.07 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  53.56 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  50.63 
 
 		 245 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  49.37 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  49.37 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  48.96 
 
 		 243 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  50.42 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  46.25 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  47.11 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  48.12 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  46.44 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  49.79 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  47.7 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  42.68 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.63 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.66 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.13 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.92 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  39.75 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  38.2 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 225 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.64 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 239 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 242 aa  119  7e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  38.94 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 235 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  33.47 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>