More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5259 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  55.83 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  50.21 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  44.49 
 
 		 252 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  41.63 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  39.21 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.86 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  41.03 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  39.22 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  40.17 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  36.91 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 243 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.89 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  37.83 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.73 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 248 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  38.72 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  39.42 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.14 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  38.3 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 251 aa  108  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  37.87 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  37.04 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.53 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.69 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  33 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  33.5 
 
 		 239 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>