More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4635 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  59.41 
 
 		 238 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  47.08 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  45.57 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.74 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 		 246 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 242 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  29.91 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  25.44 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 277 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 241 aa  92.4  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  28.4 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  25.42 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.57 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.57 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 264 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 219 aa  89  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  27.54 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>