More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4392 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  37.45 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  37.29 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 247 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.69 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  35.74 
 
 		 243 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2619  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  33.19 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.77 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  34.35 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  32.61 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  32.72 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 242 aa  102  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.34 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 238 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 232 aa  96.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 256 aa  95.9  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  27.69 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 250 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 259 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  31.74 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 238 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.54 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2477  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 244 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.698104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 236 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 264 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 232 aa  92  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.96 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.34 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>