More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2299 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
258 aa  536  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  47.43 
 
 
264 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5851  GntR family transcriptional regulator  45.78 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 
247 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
255 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 
260 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
248 aa  116  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 
257 aa  111  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
242 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
255 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
240 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
241 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
241 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
249 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.43 
 
 
240 aa  102  9e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 
241 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 
246 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
258 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 
244 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.11 
 
 
243 aa  99  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  25.99 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  25.55 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.55 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.55 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  25.55 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 
241 aa  96.3  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.55 
 
 
240 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
256 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  28.64 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.62 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
285 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.75 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  25.58 
 
 
263 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
268 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  25.52 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  26.38 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
257 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  26.96 
 
 
242 aa  92.8  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  31.72 
 
 
277 aa  92  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
245 aa  92  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
239 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  22.5 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  27.42 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  26.69 
 
 
269 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 
250 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
257 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  27.02 
 
 
254 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  24.69 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
245 aa  89  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003719  histidine utilization repressor  27.57 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.746481  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 
246 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>