More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0342 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 249 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 225 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3791  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  30.25 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  30.25 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.97 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.66 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  30.25 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  29.83 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  28.99 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 248 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  34.68 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 267 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 258 aa  89.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 271 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.53 
 
 		 256 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.03 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  23.81 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  32.19 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>