More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4157 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  39.48 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  39.06 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  35.71 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 243 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 247 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  29.39 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  27.57 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5996  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 238 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  27.05 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  27.05 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  27.05 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  27.05 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  27.05 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2585  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1176  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.33 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2399  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.720862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3313  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3347  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.546924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0315  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.33 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5874  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.62 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.166435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3357  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  31.33 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.568535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0213  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  32.44 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4033  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  32.44 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  30.57 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.33 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0146  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  30.13 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  30.13 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  30.13 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  30.13 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.96 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.51 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 271 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 271 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.47 
 
 		 235 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 236 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 242 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>