More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5560 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  80.25 
 
 		 246 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  78.51 
 
 		 245 aa  368  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  66.12 
 
 		 245 aa  318  7e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 246 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  61.57 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  61.07 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  60.74 
 
 		 243 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  60.33 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  58.26 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  50.82 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  51.82 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  52.65 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  52.28 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  46.47 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  51.04 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  42.06 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.56 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.25 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  35.06 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 248 aa  111  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2768  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.34 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.72 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  34.2 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.51 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.94 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  31.47 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0903  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 276 aa  99.4  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.634151 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.8 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.02 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  35 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 243 aa  98.2  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  33.75 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  32.92 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.15 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 233 aa  97.1  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 244 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>