More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1614 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1614  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.842348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  37.39 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  31.93 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.54 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 239 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.54 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  33.91 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  33.9 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 266 aa  85.5  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  31.47 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.5 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  32.27 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  30.68 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2893  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  29.22 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.56 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  35.09 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  27.45 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2570  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000448817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.8 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.8 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>