More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2738 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2738  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  476  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0220  regulatory protein GntR, HTH  42.37 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4179  regulatory protein GntR HTH  40.93 
 
 		 243 aa  167  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0447  regulatory protein GntR, HTH  41.6 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0190  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0181  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0170  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.321689 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.89 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  30.17 
 
 		 274 aa  95.5  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  30.42 
 
 		 277 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4790  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4496  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4409  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2066  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118637  normal  0.754365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4083  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1582  GntR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.269882 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 376 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3625  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0484961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3677  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0617  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0539833 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 376 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 241 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1484  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1440  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944848 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5470  GntR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  31.28 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  29.22 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0342  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0407848  hitchhiker  0.000377769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.92 
 
 		 256 aa  81.6  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  24.68 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  29.53 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1785  regulatory protein GntR, HTH  25.1 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  0.392955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5518  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0560672  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4186  GntR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  27.16 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  29.05 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  29.23 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  27.05 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4063  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4965  regulatory protein GntR, HTH  26.05 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  27.31 
 
 		 579 aa  79  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>