More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1857 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 242 aa  497  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 248 aa  128  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35.02 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 256 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.43 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.25 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.58 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 243 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  30.38 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.49 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  31.74 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  28.03 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  29.06 
 
 		 245 aa  99.4  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 250 aa  98.6  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  30.67 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 244 aa  97.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 241 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 240 aa  95.5  6e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.63 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0724  transcriptional regulator, GntR family  27.85 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  32.38 
 
 		 270 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  28.87 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 284 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3004  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000311693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>