More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7203 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  53.36 
 
 		 240 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  47.86 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  40.47 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  37.99 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  38.43 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.05 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  36.4 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.22 
 
 		 246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.56 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 240 aa  106  5e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.6 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  32.13 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.44 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  30.28 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.17 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 274 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 265 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 241 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 195 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 286 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 241 aa  92.8  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.19 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  35.65 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 246 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>