More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0836 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  85.77 
 
 		 246 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 246 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  52.28 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  52.46 
 
 		 245 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 245 aa  238  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  51.63 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  54.55 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  47.35 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  52.48 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  53.28 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  52.48 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  50.82 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  49.58 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  45.45 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  48.13 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  42.26 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  37.07 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  36.91 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 242 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0543  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.464871  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.61 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 260 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  37.55 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 238 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  36.44 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  33.05 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.93 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5638  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 225 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 270 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1903  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.71 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.380423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  33.95 
 
 		 266 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 265 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0791  transcriptional regulator, GntR family  30.29 
 
 		 261 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  30.7 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  34.29 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 288 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4198  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  29.55 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>