More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1409 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1409  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 252 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.78 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.65 
 
 		 243 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 247 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 242 aa  98.6  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.36 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 245 aa  95.5  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  32.47 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  25.47 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0694  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 234 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 248 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.9 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  30.72 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  35.17 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3762  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.4 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  32.63 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  34.02 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.14 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  32.63 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  31.33 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5851  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0903  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.634151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  31.4 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 		 242 aa  78.6  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  29.1 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5461  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  31.15 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>