More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0574 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0574  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.391885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3001  transcriptional regulator, GntR family  42.36 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  43.36 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 255 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  39.9 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 240 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  38.57 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.78 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  35.96 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.77 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 232 aa  119  7e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 286 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  40.25 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  40.25 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  40.25 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  39.62 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  39.62 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1748  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  34.75 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20350  putative transcriptional regulator  33.9 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238526  normal  0.704224 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2009  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.82 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.378179  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2634  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.864303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 249 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  35.24 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  32.17 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  38.96 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0194  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 		 238 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000195939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  30.9 
 
 		 233 aa  101  9e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3517  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  36.23 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  36.05 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.88 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  35.12 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>