More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1636 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 231 aa  460  1e-129  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 231 aa  350  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  38.57 
 
 		 270 aa  119  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  37.12 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  37.56 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  37.07 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  37.22 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.23 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.82 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 239 aa  102  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  36.54 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 244 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 255 aa  95.1  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 255 aa  95.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 269 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  32.19 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.08 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  32.91 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  32.61 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  30.56 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  29.15 
 
 		 245 aa  92.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  33.76 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  34.08 
 
 		 251 aa  91.7  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  35.75 
 
 		 256 aa  91.7  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1020  histidine utilization repressor  30.94 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  33.5 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 266 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  33.33 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  32.05 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.67 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  32.86 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 245 aa  87.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  31.74 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  31.74 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  31.74 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  32.86 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  32.38 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  30.59 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  32.38 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 258 aa  85.9  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  31.3 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  32.22 
 
 		 253 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 254 aa  85.5  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  32.38 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  32.32 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  30.59 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  30.59 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  30.59 
 
 		 239 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 256 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  31.9 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>