More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2332 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  75.32 
 
 		 231 aa  350  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2760  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0304853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  34.8 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 255 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  33.48 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  30 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.63 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 241 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  31.3 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  32.75 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.59 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31.88 
 
 		 244 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  31.44 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  29.2 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 246 aa  88.6  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  31.88 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  26.6 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  31.34 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  31.44 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  32.26 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  30.34 
 
 		 245 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 242 aa  85.5  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  30.48 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  30.48 
 
 		 245 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  31.43 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  29.61 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  30.48 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6308  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  30 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0853  GntR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.122159  hitchhiker  0.00270002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  31.9 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  29.38 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  30.48 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  30.57 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  30.84 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  29.38 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2625  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0476677  hitchhiker  0.0068543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  29.38 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1929  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  29.38 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  30 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  30.57 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  30 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  30 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  31 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  29.38 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  30.8 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  29.52 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0096  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  31 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  28.95 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  30.5 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>