More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2059 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  100 
 
 		 228 aa  474  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  38.6 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  39.3 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  39.3 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  33.77 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  32.61 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  32.61 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  32.61 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  32.61 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  32.61 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  32.29 
 
 		 253 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  29.78 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  24.78 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.22 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0054  transcriptional regulator, GntR family  25.64 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  26.84 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.95 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  25.7 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  25.7 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4840  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.13 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3820  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0228383  hitchhiker  0.00324252 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.14 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  31.29 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1606  histidine utilization repressor  28.38 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.971553  normal  0.693248 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  24.58 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  25.88 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4236  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  24.76 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0634  UbiC transcription regulator-associated  27.65 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.124125 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4062  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4253  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.506804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  24.66 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3175  putative transcriptional regulator, GntR family  25.91 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  26.03 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  36.26 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  23.87 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  22.98 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  23.76 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>