More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2941 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2941  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.994772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0156  putative transcriptional regulator, GntR family  47.39 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  46.12 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2822  transcriptional regulator, GntR family  39.29 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0124  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33520  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal  0.208572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1284  transcriptional regulator, GntR family  35.2 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9128  putative transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.783412  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0590  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000490216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3397  GntR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1051  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.742044  normal  0.270689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3598  transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2169  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.47 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.225688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.79 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.67 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.56 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9402  putative transcriptional regulator, GntR family  34.84 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2323  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0617255  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2167  putative transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2101  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2005  transcriptional regulator, GntR family  32.22 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00857221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.83 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8553  transcriptional regulator, GntR family  30.92 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0729344  hitchhiker  0.000642156 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2943  GntR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2096  putative transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0474  transcriptional regulator, GntR family  32.26 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5605  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2197  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 244 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  33.62 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  29.92 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 225 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0700  putative transcriptional regulator, GntR family  33.6 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0152  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 237 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  29.1 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  27.09 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0718  putative transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  27.76 
 
 		 245 aa  93.6  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 244 aa  93.2  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 245 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  92  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 240 aa  92.4  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  31.58 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 242 aa  91.7  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 252 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5286  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  24.9 
 
 		 239 aa  89  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  26.89 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10808  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000218529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 244 aa  89  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4438  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3697  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00311768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>