More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0077 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  38.33 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  36.6 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  39.33 
 
 		 239 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  39.39 
 
 		 237 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  34.32 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  33.19 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  31.86 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.3 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  31.42 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 248 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  31.02 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.64 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.64 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.64 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.64 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.64 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  31.49 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.64 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.37 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.14 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  29.2 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.75 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.48 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.91 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  28.82 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  28.38 
 
 		 236 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  29.66 
 
 		 274 aa  87  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  28.82 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 332 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 249 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 376 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 376 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 266 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  29.5 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  28.82 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  29.26 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  28.51 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>