More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1472 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 238 aa  480  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  42.06 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  40.77 
 
 		 237 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 245 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  148  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 245 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  40.6 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  32.9 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  34.2 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  33.62 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  33.61 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  33.62 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  32.77 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  32.77 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  32.77 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  32.77 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.25 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  32.77 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  33.88 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  32.77 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  33.47 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.88 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.41 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.41 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.41 
 
 		 240 aa  114  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  28.94 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  27.47 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.85 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 195 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.44 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 235 aa  98.6  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 242 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 269 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  30.3 
 
 		 250 aa  96.7  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  25.22 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.19 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  25.74 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 274 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 274 aa  92.4  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>