More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1309 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
238 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 
241 aa  206  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  42.92 
 
 
237 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  37.45 
 
 
241 aa  168  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 
237 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  30.93 
 
 
239 aa  138  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
238 aa  118  9e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  30.49 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 
245 aa  116  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
242 aa  116  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 
245 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  32.31 
 
 
235 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
243 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 
237 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
243 aa  107  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
248 aa  105  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
238 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
238 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
238 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 
244 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
243 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
243 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
243 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
243 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.08 
 
 
240 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  27.31 
 
 
242 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.08 
 
 
240 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
248 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.08 
 
 
240 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.08 
 
 
240 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.08 
 
 
240 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.08 
 
 
240 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  30.08 
 
 
240 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
243 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
233 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
235 aa  95.5  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  29.66 
 
 
251 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
240 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
232 aa  92.8  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.22 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  29.28 
 
 
233 aa  89  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  25.64 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.75 
 
 
265 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  22.65 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  28.57 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
249 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  25.21 
 
 
235 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  28.14 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  30.16 
 
 
195 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  28.45 
 
 
239 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  23.48 
 
 
288 aa  85.5  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
239 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  29.26 
 
 
232 aa  85.1  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  26.43 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  28.88 
 
 
236 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  25.85 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
263 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
256 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  28.45 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>