More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0076 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  49.36 
 
 		 235 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  48.51 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  49.14 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  45.69 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 240 aa  169  5e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  39.57 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  39.15 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  40 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  40 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  39.57 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  39.57 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  33.76 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  28.4 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  32.77 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  25.93 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  25.88 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.41 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.41 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.41 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.41 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.41 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.41 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.41 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  23.56 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.74 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  26.76 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4520  transcriptional regulator, GntR family  26.97 
 
 		 278 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  30.26 
 
 		 237 aa  85.1  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  23.35 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  26.29 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3766  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  23.87 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.09 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  24.56 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1763  GntR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.102189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  22.73 
 
 		 251 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  24.78 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  23.71 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>