More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_0249 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 234 aa  485  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  29.09 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  29.3 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 225 aa  85.1  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  27.55 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  27.55 
 
 		 236 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  28.93 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  28.93 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  27.55 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  27.55 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  27.55 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  27.55 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  26.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  27.55 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  26.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  26.46 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  27.55 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  24.39 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  27.55 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  26.01 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  25.79 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  24.66 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3333  transcriptional regulator, GntR family  28.89 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  23.08 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  25.46 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  25.82 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  26.09 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  24.32 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0087  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0530436  normal  0.993095 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  23.61 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.99 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  26.79 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  23.61 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0145  GntR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  24.07 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  27.39 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  25.49 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>