More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2552 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2552  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1622  transcriptional regulator, GntR family  79.32 
 
 		 246 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  54.94 
 
 		 235 aa  263  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  54.94 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  45.69 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  45.73 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  45.73 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  45.73 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  45.73 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  44.87 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  45.73 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  44.87 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  45.73 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  45.3 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0480  GntR family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00570822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1339  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.344054  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0534  transcriptional regulator  39.83 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.207932  hitchhiker  0.0000000000234574 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0510  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0497  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0510  trehalose operon repressor  37.08 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2016  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.47195  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1334  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  decreased coverage  0.000248139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0603  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.971454  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0191  transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.168496 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  27.43 
 
 		 245 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.76 
 
 		 240 aa  93.6  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0188  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0560306 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  28.33 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.33 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.33 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  28.33 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  29.69 
 
 		 238 aa  89  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  28.33 
 
 		 240 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  27.66 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.99 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  27.23 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1435  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.851115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  27.59 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3837  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.10255  normal  0.78635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3786  transcriptional regulator, GntR family  26.42 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  26.78 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  28.99 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  26.22 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 267 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0249  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0255  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.21 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  28.11 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  28.11 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  24.34 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  28.11 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  25.81 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>