More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3873 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 244 aa  480  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 247 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  34.73 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  32.03 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 256 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2998  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31.2 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0698  trehalose operon transcriptional repressor  34.69 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0759  trehalose operon repressor  34.69 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0597  trehalose operon transcriptional repressor  34.69 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.464881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0630  trehalose operon transcriptional repressor  34.69 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1962  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00453299  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  32.9 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.69 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0541  trehalose operon transcriptional repressor  34.69 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 239 aa  106  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4671  trehalose operon repressor  34.58 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.38863e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0685  trehalose operon repressor  34.69 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.327487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0543  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0666  trehalose operon repressor  33.75 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  31.6 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  28.88 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  29.79 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  29.24 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.24 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  29.24 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.24 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1309  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.49 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0559  transcriptional regulator  32.13 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128597  hitchhiker  0.00000147754 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  29.24 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1687  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.24 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  26.61 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0076  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 233 aa  99.8  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  26.52 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3202  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  29.85 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  27.12 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3111  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1211  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3204  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3458  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  28.69 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  28.27 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 244 aa  92.8  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3436  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 195 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>