More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000660 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  49.77 
 
 		 238 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  49.32 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  49.34 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  49.34 
 
 		 238 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  48 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  49.1 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  45.81 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  47.83 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  46.81 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  47.3 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 237 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  40 
 
 		 234 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  40.26 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  41.78 
 
 		 239 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  41.33 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  41.33 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  41.33 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  41.78 
 
 		 263 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  41.33 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  38.22 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  38.7 
 
 		 239 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  38.7 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 236 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  29.78 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 244 aa  99  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4157  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.82 
 
 		 263 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 261 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  26.67 
 
 		 261 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 258 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  28.39 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0464969 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5939  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4783  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  28.37 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133972  normal  0.113518 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.24 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0767  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3327  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  26.94 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0812  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.09 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3873  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  27.4 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  27.48 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  29.07 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>