More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4489 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  67.97 
 
 		 235 aa  322  4e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  66.24 
 
 		 235 aa  320  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  63.95 
 
 		 238 aa  298  4e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  62.5 
 
 		 238 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  62.5 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  63.52 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 237 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  58.19 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  57.39 
 
 		 253 aa  264  7e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 237 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  57.33 
 
 		 239 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  47.39 
 
 		 242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  43.69 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  43.69 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  43.69 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  43.69 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  43.69 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  42.48 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  42.48 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  43.36 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  40.71 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  41.63 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  37.28 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4114  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5318  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4257  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03757  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.2 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4099  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4144  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.815119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4395  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03706  hypothetical protein  31.44 
 
 		 233 aa  129  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  29.68 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 244 aa  91.7  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  28.57 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 243 aa  89  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 252 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 241 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5939  transcriptional regulator, GntR family  27.88 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.97 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 252 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2178  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0464969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2078  GntR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.11 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  26.27 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0456  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0420  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.330179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  25.66 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.49 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3313  phosphonates metabolism transcriptional regulator PhnF  27.04 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>