More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08770 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2067  transcriptional regulator, GntR family  46.47 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1175  transcriptional regulator, GntR family  46.06 
 
 
243 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2444  GntR family transcriptional regulator  44.4 
 
 
241 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3827  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000115432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3840  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3644  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000015219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3534  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3552  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000156327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3805  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78065e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3928  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
241 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000328023  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3563  GntR family transcriptional regulator  44.08 
 
 
246 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1778  transcriptional regulator, GntR family  43.78 
 
 
246 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00599457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1408  transcriptional regulator, GntR family  44.08 
 
 
241 aa  186  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000166649  hitchhiker  0.000517226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3891  transcriptional regulator, GntR family  42.67 
 
 
228 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1883  GntR family transcriptional regulator  39.57 
 
 
246 aa  164  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2843  GntR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
243 aa  131  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.726493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.88 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.88 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0402  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
239 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
225 aa  115  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.83 
 
 
235 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  31.36 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0303  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2778  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
249 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.021703  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
256 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  28.81 
 
 
261 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
258 aa  111  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  29.44 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1363  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 
237 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1337  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
237 aa  110  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.617468  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3644  hypothetical protein  29.74 
 
 
240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.128261  normal  0.0387613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
249 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
239 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
249 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 
270 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0942  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 
248 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 
242 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
233 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
242 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
244 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
244 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  29.88 
 
 
244 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  28.38 
 
 
246 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.7 
 
 
233 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 
248 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3947  GntR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
241 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
248 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 
245 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  27.54 
 
 
240 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.54 
 
 
240 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  27.54 
 
 
240 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.54 
 
 
240 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 
240 aa  102  5e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  27.97 
 
 
249 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
240 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
244 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.12 
 
 
240 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1596  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 
243 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0922621  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
244 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  29.83 
 
 
243 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
244 aa  101  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  30.13 
 
 
245 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  27.54 
 
 
240 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
244 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
260 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
240 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
260 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  29.46 
 
 
263 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 
244 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
260 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 
252 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.54 
 
 
240 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
232 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  29.07 
 
 
278 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05080  transcriptional regulator  31.78 
 
 
259 aa  99.8  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.764166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>