More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0894 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  81.38 
 
 		 256 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 251 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 		 242 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  42.54 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  40.16 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 332 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 376 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 258 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  39.04 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  37.4 
 
 		 286 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 251 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  36.75 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 274 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  34.7 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  32.89 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  32.46 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 240 aa  99  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 244 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.54 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 257 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  30.59 
 
 		 277 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 244 aa  92.4  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 264 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 241 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 240 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  30.36 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 248 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 242 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3370  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 248 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.99 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>