More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3817 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  81.38 
 
 		 280 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 259 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  41.77 
 
 		 248 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  40.61 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  39.32 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 274 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 376 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  37.61 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 376 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  36.43 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.46 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  36.73 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 249 aa  142  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 274 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 262 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 246 aa  135  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  31.14 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 240 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  31.14 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 240 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  29.39 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 264 aa  92  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.17 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 277 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.82 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  27.63 
 
 		 277 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  32.78 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  29.46 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  26.58 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1471  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>