More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6218 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  91.06 
 
 		 246 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 245 aa  159  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  39.04 
 
 		 280 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  32.77 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  32.35 
 
 		 274 aa  142  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.45 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 284 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 284 aa  139  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 376 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 258 aa  138  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 264 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 271 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 274 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.4 
 
 		 286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 265 aa  121  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 240 aa  118  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 245 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  33.64 
 
 		 240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.02 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  28.63 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  30.74 
 
 		 243 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  31.34 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0955  transcriptional regulator, GntR family  31.8 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 241 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 244 aa  98.6  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  27.6 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.21 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  25.31 
 
 		 252 aa  95.1  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  25.48 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.95 
 
 		 265 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  28.95 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>