More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0525 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  503  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  42.17 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.27 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  34.98 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 332 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 376 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  37.05 
 
 		 266 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 245 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 274 aa  141  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  34.03 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.5 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.02 
 
 		 286 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 270 aa  128  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 277 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 251 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  31.2 
 
 		 277 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  29.66 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.26 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.26 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.26 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.26 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.13 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  27.16 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.26 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.26 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  29.82 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  27.92 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4080  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.08 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.515439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.64 
 
 		 235 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>