More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1749 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 332 aa  217  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 376 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 266 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 376 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 259 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  44.59 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  46.75 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  44.16 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 251 aa  204  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  45.61 
 
 		 242 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.29 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 287 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 284 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  44.26 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  42.98 
 
 		 262 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  44.73 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  43.1 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.92 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  42.54 
 
 		 280 aa  185  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  38.91 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  40.61 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  36.53 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  33.33 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  36.07 
 
 		 240 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 251 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 241 aa  126  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 308 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3799  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392461  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  31.53 
 
 		 243 aa  102  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0722  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 239 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  27.71 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.71 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.71 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  27.71 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.71 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  27.71 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.46 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.46 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.46 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.46 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>