More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2171 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2171  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2707  GntR family transcriptional regulator  70.63 
 
 		 259 aa  362  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0952006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3599  GntR family transcriptional regulator  68.33 
 
 		 256 aa  333  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2152  transcriptional regulator, GntR family  63.12 
 
 		 269 aa  331  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1828  transcriptional regulator, GntR family  67.65 
 
 		 258 aa  330  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49594 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4649  GntR family transcriptional regulator  69.75 
 
 		 274 aa  329  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.492673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1997  transcription regulator protein  67.65 
 
 		 274 aa  329  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.38113  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2792  GntR family transcriptional regulator  65.12 
 
 		 284 aa  328  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.120812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2488  GntR family transcriptional regulator  67.37 
 
 		 284 aa  325  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0312157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2326  GntR family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 287 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2205  GntR family transcriptional regulator  63.32 
 
 		 278 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1431  transcriptional regulator, GntR family  66.8 
 
 		 270 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4355  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  65.42 
 
 		 256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0659  GntR family transcriptional regulator  66.39 
 
 		 376 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.263292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2282  transcriptional regulator, GntR family  65.55 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.557929  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2428  GntR family transcriptional regulator  62.02 
 
 		 262 aa  319  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3826  GntR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 271 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.339728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2153  GntR family transcriptional regulator  68.22 
 
 		 274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3310  GntR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.758694 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2473  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1828  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0948232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1620  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2335  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.991331  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0498  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687826  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1750  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 332 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0794  GntR family transcriptional regulator  65.97 
 
 		 376 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3031  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  65.83 
 
 		 286 aa  316  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.921184 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1802  GntR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0871111  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6857  transcriptional regulator, GntR family  65 
 
 		 266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.314897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2896  GntR family transcriptional regulator  65 
 
 		 267 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3595  GntR family transcriptional regulator  67.93 
 
 		 274 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4434  GntR family transcriptional regulator  67.93 
 
 		 274 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3933  GntR family transcriptional regulator  67.93 
 
 		 274 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4360  GntR family transcriptional regulator  65.82 
 
 		 266 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  60.5 
 
 		 242 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0757  GntR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 245 aa  278  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1064  transcriptional regulator, GntR family  54.88 
 
 		 245 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.296534  normal  0.0288799 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2365  transcriptional regulator, GntR family  48.35 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1749  transcriptional regulator, GntR family  44.67 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.37809  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0894  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  41.49 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1764  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.140741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3533  GntR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 246 aa  158  9e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3708  transcriptional regulator, GntR family  40.95 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5975  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.360612 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1994  transcriptional regulator, GntR family  39.34 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3817  transcriptional regulator, GntR family  39.24 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0594434  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  37.77 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6218  transcriptional regulator, GntR family  34.89 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4103  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1697  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.394486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4023  GntR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2860  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.747318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1251  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116745  normal  0.0613053 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0949  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0214  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892015  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1885  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1390  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0431  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1800  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00723826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0349  transcriptional regulatory protein  36 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4833  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  36.36 
 
 		 240 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5190  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702411  normal  0.0588532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1096  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7148  transcriptional regulator, GntR family  34.7 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.263147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.7 
 
 		 243 aa  109  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 278 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  35 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0995  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.352191  normal  0.964514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  31.65 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  33.94 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  31.49 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>